從最新公布的《新型農業經營主體發展指數調查(三期)報告》可以看出，實行無公害、綠色或有機農產品認證增強了新型農業經營主體的盈利能力，政府應進一步加大支持力度，推進農產品認證工作，完善認證獎勵和補貼制度，促進更多新型農業經營主體實行農產品質量認證，增加農業收益。但是實行無公害、綠色或有機農產品認證對家庭農場的贏利能力卻有負面影響，可能是導致新型經營主體認證率低的主要原因，應進一步完善農產品價格傳導機制，實現農產品“優質優價”，多元化推動農產品認證體系的發展與完善，尤其重點關注家庭農場的價格傳導機制，找出阻礙家庭農場通過認證提高收益的原因。

　　此外，新型農業經營主體綠色生態可持續生產仍有提升空間，家庭農場和種養大戶在化肥、農藥、農膜等方面的投入較多，相比于中部地區和西部地區，東部地區的新型農業經營主體在這方面的投入最多。

　　應對這個問題，首先應貫徹落實國家現有政策法規。依據《到2020年化肥使用量零增長行動方案》，推進精準施肥，調整化肥使用結構，改進施肥方式，用有機肥替代化肥?！斗桨浮诽岢?，重點在“控、替、精、統”四個字上下功夫，控制病蟲發生危害，高效低毒低殘留農藥代替高毒高殘留農藥、大中型高效藥械替代小型低效藥械，推行精準科學施藥，推行病蟲害統防統治。其次，增強新型農業經營主體對綠色生產方式的重視程度。對種養大戶和家庭農場而言，化肥、農藥和農膜的投入量較多，都呈現增加態勢。盡管國家鼓勵和建議使用有機肥和高效低毒低殘留農藥以及精準施藥，但仍要進一步引起重視。先從新型農業經營主體開始，發揮其引領作用，引領全國農業走向綠色發展道路。再次，研發更為高效的有機肥、混合肥和低毒農藥，降低價格，為施用和推廣提供激勵。一方面，盡管現有政策規定對有機肥的生產和銷售免稅，對銷售或進口農藥和化肥減稅，但這僅是經營方面的舉措，應把更多政策落實在使用方面。另一方面，研發更為高效的有機肥、混合肥和低毒農藥，促使農民為提高生產效率而選擇更為綠色的生產方式。最后，對不同地區的污染問題，給予不同程度的重視。為了更精準有效地減少農業污染，需要控制和減少東部地區新型農業經營主體在農藥、化肥、農膜等方面的投入。

　　新型農業經營主體采用節水灌溉技術的占比僅為35%。應繼續在新型農業經營主體間大力推廣節水灌溉技術，提高節水意識。分析發現，新型農業經營主體負責人受教育水平越高和經營規模越大，采用節水灌溉技術的概率越大，因此應提高企業人力資本，鼓勵新型農業經營主體進一步實現適度規模經營。此外，可以鼓勵農民專業合作社和農業產業化龍頭企業承擔起對農戶的帶動作用，為內部成員開展節水灌溉技術培訓、灌溉設施維護等，動員農戶以集體為單位，大力推廣采用節水灌溉技術。

　　調研顯示，農業產業化龍頭企業使用清潔能源呈上升趨勢，但上升幅度較小，存在很大提升空間。在發展過程中，龍頭企業需要更多地向低消耗、低排放趨勢轉變，積極采用與推廣節能減排先進技術，逐步淘汰傳統、落后的生產技術，并進一步使用清潔能源替代傳統能源。政府應該將農業產業化龍頭企業節能減排列入對農業產業化龍頭企業的考察與管理之內，促進農業產業化龍頭企業積極轉型，承擔節能的社會責任，以一種低成本、友好型的生產形式代替高能耗的落后生產模式。

　　繼續促進新型農業經營主體采用涵養土地的生產方式，實現農業的可持續發展。數據顯示，有17.76%的牧地草地類家庭農場實行輪休，21.62%的牧地草地類種養大戶實行輪休，比例仍然較低。應針對新型農業經營主體建立合理的土地輪休補助，促進更多新型農業經營主體采用可持續的土地利用方式。